关于种属鉴定、NCBI的BLAST比对和DNAMAN同源性分析的问题测得某DNA样本基因序列是ACCGCCTGCCCAGTGACACATGTTTAACGGCCGCGGTACCCTAACCGTGCAAAGGTAGCATAATCACTTGTTCCTTAAATAGGGACCTGTATGAATGGCTCCACGAGGGTTCAGCTGTCTCTTACTTTTAACCAGTGAAATTGAC

来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/04/29 17:34:52
关于种属鉴定、NCBI的BLAST比对和DNAMAN同源性分析的问题测得某DNA样本基因序列是ACCGCCTGCCCAGTGACACATGTTTAACGGCCGCGGTACCCTAACCGTGCAAAGGTAGCATAATCACTTGTTCCTTAAATAGGGACCTGTATGAATGGCTCCACGAGGGTTCAGCTGTCTCTTACTTTTAACCAGTGAAATTGAC

关于种属鉴定、NCBI的BLAST比对和DNAMAN同源性分析的问题测得某DNA样本基因序列是ACCGCCTGCCCAGTGACACATGTTTAACGGCCGCGGTACCCTAACCGTGCAAAGGTAGCATAATCACTTGTTCCTTAAATAGGGACCTGTATGAATGGCTCCACGAGGGTTCAGCTGTCTCTTACTTTTAACCAGTGAAATTGAC
关于种属鉴定、NCBI的BLAST比对和DNAMAN同源性分析的问题
测得某DNA样本基因序列是
ACCGCCTGCCCAGTGACACATGTTTAACGGCCGCGGTACCCTAACCGTGCAAAGGTAGCATAATCACTTGTTCCTTAAAT
AGGGACCTGTATGAATGGCTCCACGAGGGTTCAGCTGTCTCTTACTTTTAACCAGTGAAATTGACCTGCCCGTGAAGAGG
CGGGCATGACACAGCAAGACGAGAAGACCCTATGGAGCTTTAATTTATTAATGCAAACAGTACCTAACAAACCCACAGGT
CCTAAACTACCAAACCTGCATTAAAAATTTCGGTTGGGGCGACCTCGGAGCAGAACCCAACCTCCGAGCAGTACATGCTA
AGACTTCACCAGTCAAAGCGAACTACTATACTCAATTGATCCAATAACTTGACCAACGGAACAAGTTACCCTAGGGATAA
CAGCGCAATCCTATTCTAGAGTCCATATCAACAATAGGGTTTACGACCTCGATGTTGGATCAGGACATCCCGATGGTGCA
GCCGCTATTAAAGGTTCGTTTGTTCAACGATTAAAGTCCTACGTGATCTGAGT
现在想鉴定是什么种属。是不是通过BLAST 序列比对,然后进行同源性分析?

关于种属鉴定、NCBI的BLAST比对和DNAMAN同源性分析的问题测得某DNA样本基因序列是ACCGCCTGCCCAGTGACACATGTTTAACGGCCGCGGTACCCTAACCGTGCAAAGGTAGCATAATCACTTGTTCCTTAAATAGGGACCTGTATGAATGGCTCCACGAGGGTTCAGCTGTCTCTTACTTTTAACCAGTGAAATTGAC
ncbi主页 进入 blast 进入 nucleotide blast 将序列粘入窗口中 选择nucleotide cllection(nr/nt)选项 进行比对就可以了 出来的序列相似性最高的就是你的目的序列

关于种属鉴定、NCBI的BLAST比对和DNAMAN同源性分析的问题测得某DNA样本基因序列是ACCGCCTGCCCAGTGACACATGTTTAACGGCCGCGGTACCCTAACCGTGCAAAGGTAGCATAATCACTTGTTCCTTAAATAGGGACCTGTATGAATGGCTCCACGAGGGTTCAGCTGTCTCTTACTTTTAACCAGTGAAATTGAC ncbi上的blast序列比对工具怎么使用,求具体操作指南. NCBI Blast 中的黑色、蓝色、绿色、粉色和红色都是什么意思?在 NCBI 中进行核酸序列比对,比对结果的 Graphic Summary 中会有黑色、蓝色、绿色、粉色和红色的代表一些数值的标记, 如何进行BLAST比对?急救啊,朋友!本人是新手,获得了未知菌的16Srdna序列后,进入http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/中进行比对,页面中有BLAST Assembled Genomes和Basic BLAST之分,请教我该进入哪里,我不知道该把 有谁知道NCBI blast检测基因序列比对结果怎么看的吗?求懂的大神们指教 16SrDNA测序后在ncbi上比对细菌鉴定,16SrDNApcr扩增测序之后用blast比对,出来一个相似度99%的菌种,怎样体现数据库也是用16SrDNA序列跟我做的序列匹配的呢?换句话说,我想知道这99%相似度是不是我 blast检验引物特异性NCBI上没有我所要物种的某基因序列,设计引物时我用人的序列做模版,想问下还有没有blast比对的意义,如果有该怎样去比对呢, NCBI中的BLAST功能可以查多个基因之间的比对吗?比如我想查金黄色葡萄球菌NUC基因与其他葡萄球菌NUC基因之间的比对 找出一个特异性好的区段 请问下BLAST可以做到吗? ncbi使用攻略blast 基因比对 最好详细点 包括每个选项的特殊功用有哪些!请高人指导,谢谢! 运用NCBI-BLAST和PDB搜索工具搜P03958序列的相似序列和相似的结构,并对结果进行解? NCBI Blast 中的Score blast ncbi上面由于本人对blast不是很熟悉.5' AACCATTTTGTGGACGAA 3' 关于已知DNA序列在NCBI上比对并鉴定菌种1.我做细菌鉴定,把16srDNA PCR后拿出去双向测序,得到了两条序列,一条正的,一条反的,在比对以前是要把它整合成一条链吗?怎样整合?如何鉴定.两条链如下 NCBI进行BLAST检索时Query coverage的同源百分比和Max ident的百分比分别是什么意思,怎么得到的?如果得分一样时,哪个结果所占比重比较大? 动物dna序列为什么在ncbi上比对完和植物的该基因相似 关于DNA序列在NCBI上比对的问题1.我做细菌鉴定,把16srDNA PCR后拿出去测序,得到了两条序列,一条正的,一条反的,在比对以前是要把它整合成一条链吗?怎样整合?2.请大概说一下,我想知道是什么菌, (生物信息学)用NCBI primer-blast设计引物的 时候“misprimed product”是啥意思NCBI primer-blast的数据库构建是什么原理呢? ncbi蛋白blast结果ncbi蛋白blast结果中,相同氨基酸残基已经用单字母标出了,不同的残基有的是空白,有的+号,